為做好2024年江門市病原宏基因及細(xì)菌全基因組等測(cè)序工作，現(xiàn)向社會(huì)廣泛征集測(cè)序服務(wù)提供單位，現(xiàn)將有關(guān)事項(xiàng)公告如下：

　　一、項(xiàng)目?jī)?nèi)容

　　對(duì)相關(guān)樣本開展病原宏基因組、細(xì)菌全基因組測(cè)序及病原一代測(cè)序服務(wù)。

　　二、服務(wù)機(jī)構(gòu)資質(zhì)要求

　　（一）參加單位符合《中華人民共和國政府采購法》第二十二條的規(guī)定。

　　（二）在中華人民共和國境內(nèi)注冊(cè)的具有獨(dú)立承擔(dān)民事責(zé)任的法人或其他組織，并獲得工商營業(yè)執(zhí)照。

　　（三）投標(biāo)人須具備相關(guān)服務(wù)的資質(zhì)或者獲得具有相關(guān)資質(zhì)單位的授權(quán)，提供相關(guān)資質(zhì)證明和授權(quán)文件。

　　三、提交材料

　　（一）提供在中華人民共和國境內(nèi)注冊(cè)的法人或其他組織的營業(yè)執(zhí)照或事業(yè)單位法人證書或社會(huì)團(tuán)體法人登記證書復(fù)印件。

　　（二）提供測(cè)序服務(wù)的資質(zhì)或者獲得具有相關(guān)資質(zhì)單位的授權(quán)，提供相關(guān)資質(zhì)證明和授權(quán)文件。

　　（三）相關(guān)項(xiàng)目與3家以上相關(guān)單位有合作，每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測(cè)報(bào)告作為證明。

　　四、項(xiàng)目?jī)?nèi)容說明

　　（一）項(xiàng)目目標(biāo)

　　為進(jìn)一步加強(qiáng)我市病原監(jiān)測(cè)、鑒定和分析預(yù)警，及時(shí)掌握我市病原特征和流行態(tài)勢(shì)，為傳染病的發(fā)現(xiàn)、識(shí)別、疫情預(yù)警提供科學(xué)依據(jù)。

　　（二）標(biāo)本接收

　　1、投標(biāo)人承擔(dān)本項(xiàng)目所有樣本轉(zhuǎn)運(yùn)物流工作，提供可查詢的物流運(yùn)輸，確保樣本運(yùn)輸?shù)臅r(shí)效性、安全性，并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測(cè)對(duì)樣本質(zhì)量的要求。

　　2、服務(wù)供應(yīng)商應(yīng)制定具體的物流方案，規(guī)范標(biāo)本接收、登記流程，確保標(biāo)本順利交接，方便核查。

　　3、服務(wù)供應(yīng)商須按照標(biāo)本必需的條件進(jìn)行運(yùn)輸，收取標(biāo)本時(shí)，應(yīng)核對(duì)標(biāo)本信息，仔細(xì)檢查標(biāo)記、封口、數(shù)量等以保證符合檢測(cè)的要求，確認(rèn)無誤后方可接收標(biāo)本。妥善運(yùn)輸、處理和保存標(biāo)本，保證標(biāo)本質(zhì)量和安全，防止出現(xiàn)標(biāo)本丟失、傾瀉、破裂等事故。

　　4、服務(wù)供應(yīng)商須制定相應(yīng)的保密工作程序，保證標(biāo)本的相關(guān)信息及資料保密工作。

　　五、樣本檢測(cè)與要求

　　（一）病原一代測(cè)序技術(shù)服務(wù)

　　1、采購數(shù)量:50份，最高限價(jià)60元/樣本。

　　2、技術(shù)要求：

　　（1）要求使用一代測(cè)序平臺(tái)，對(duì)送檢的樣本進(jìn)行sanger法測(cè)序。

　　（2）要求對(duì)被檢樣品進(jìn)行核酸提取、反轉(zhuǎn)錄和巢式PCR擴(kuò)增，并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行一代測(cè)序和結(jié)果處理分析。

　　（3）要求對(duì)擴(kuò)增后的PCR產(chǎn)物純化后直接測(cè)序，若一次測(cè)序結(jié)果不理想，需技術(shù)分析后進(jìn)行優(yōu)化測(cè)序。

　　（4）數(shù)據(jù)分析：要求對(duì)測(cè)序產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行基因系統(tǒng)進(jìn)化和耐藥位點(diǎn)分析并提供分析報(bào)告。

　　（5）可接受不定時(shí)分批送樣，為保證報(bào)告周期，從下單開始計(jì)算，24小時(shí)內(nèi)完成收樣、檢測(cè)與報(bào)告發(fā)放。檢測(cè)原始數(shù)據(jù)需48小時(shí)內(nèi)報(bào)送到投標(biāo)人。（需提供書面承諾函并加蓋公章）

　　（6）相關(guān)項(xiàng)目（一代測(cè)序分析項(xiàng)目）與不少于3家以上醫(yī)療防控單位有合作，每家單位提供一份合作協(xié)議作為證明。

　　（7）檢測(cè)標(biāo)本類型為痰、腦脊液、肺泡灌洗液、血液、糞便、或分離后的菌株等，供應(yīng)商需提供采樣說明以及采樣要求和運(yùn)輸要求說明。

　　（8）服務(wù)供應(yīng)商需提供本項(xiàng)目中所提及的完整測(cè)序方案及檢測(cè)過程中的質(zhì)控方案。

　　（9）具有優(yōu)秀的質(zhì)量保證體系和工作流程，控制高通量測(cè)序過程中出現(xiàn)的樣本混淆情況。結(jié)賬時(shí)只支付檢測(cè)成功的樣本費(fèi)用。

　　（二）細(xì)菌全基因組測(cè)序服務(wù)

　　1、采購數(shù)量:60份，最高限價(jià)450元/株。

　　2、技術(shù)要求：

　　（1）要求對(duì)送檢的樣本進(jìn)行核酸提取，并進(jìn)行菌種鑒定，對(duì)符合要求的樣本進(jìn)行二代測(cè)序。

　　（2）要求使用Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，測(cè)序讀長(zhǎng)為2X150bp及以上；測(cè)序的原始數(shù)據(jù)量（堿基數(shù)）≥5G；堿基數(shù)據(jù)質(zhì)量值Q30比例≥85%；Q20有效數(shù)據(jù)量（Clean data）≥1G。

　　（3）要求對(duì)新測(cè)序的基因組進(jìn)行初步序列組裝和編碼基因預(yù)測(cè)，并進(jìn)行基本病原特征分析，如毒力基因，耐藥基因及MLST分型等。（投標(biāo)人需提供書面承諾書）

　　（4）可接受不定時(shí)分批送樣，為保證報(bào)告周期，從下單開始計(jì)算，10天內(nèi)完成收樣、檢測(cè)與個(gè)性化分析報(bào)告、原始數(shù)據(jù)和拼接數(shù)據(jù)的發(fā)放。（投標(biāo)人需提供書面承諾書）

　　（5）能提供3次售后分析機(jī)會(huì)，能提供個(gè)性化作圖，能提供對(duì)應(yīng)的技術(shù)指導(dǎo)。

　　（6）為保證檢測(cè)質(zhì)量和售后服務(wù)，檢測(cè)機(jī)構(gòu)具有針對(duì)病原宏基因組或致病菌高通量檢測(cè)項(xiàng)目檢測(cè)技術(shù)的能力，提供證明資料。

　　（7）投標(biāo)人承擔(dān)本項(xiàng)目所有樣本轉(zhuǎn)運(yùn)物流工作，提供可查詢的物流運(yùn)輸，確保樣本運(yùn)輸?shù)臅r(shí)效性、安全性，并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測(cè)對(duì)樣本質(zhì)量的要求。

　　（8）相關(guān)項(xiàng)目（細(xì)菌二代高通量檢測(cè)）與3家以上相關(guān)單位的科室有合作，每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測(cè)報(bào)告作為證明。

　　（9）服務(wù)供應(yīng)商配備專門的服務(wù)團(tuán)隊(duì)，對(duì)發(fā)放后的報(bào)告進(jìn)行解讀，并安排分析人員上門為期兩周的個(gè)性化分析結(jié)果及方法進(jìn)行培訓(xùn)，使用者若有需求，可以2小時(shí)內(nèi)到達(dá)，處理客戶相關(guān)的數(shù)據(jù)問題。

　　（三）宏基因組測(cè)序分析服務(wù)

　　1、采購數(shù)量:60份,最高限價(jià)800元/樣本。

　　2、技術(shù)要求：

　　（1）提取：有針對(duì)各類樣本對(duì)應(yīng)的DNA提取試劑盒/CTAB法/SDS法，進(jìn)行基因組DNA抽提后，有處理特殊標(biāo)本的能力，利用Thermo NanoDrop One檢測(cè)DNA的純度和濃度。

　　（2）建庫：按照Illumina標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行建庫操作。

　　（3）測(cè)序：使用 Illumina Nova 6000平臺(tái)對(duì)構(gòu)建的擴(kuò)增子文庫進(jìn)行PE150測(cè)序，保證每個(gè)樣本的下機(jī)測(cè)序數(shù)據(jù)量≥60G。（投標(biāo)人需提供書面承諾書）

　　（4）分析：對(duì)原始數(shù)據(jù)過濾拼接，通過MetaPhlAn3及HUMAnN3注釋及功能注釋，同時(shí)可以對(duì)特定的序列進(jìn)行定量分析。有云平臺(tái)分析系統(tǒng)，包括OUT聚類物種注釋，物種群落分析，alpha多樣性分析，beta多樣性分析，物種差異分析，環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析，菌群功能分析，菌群和環(huán)境暴露網(wǎng)絡(luò)分析，中介效應(yīng)分析。

　　（5）能提供3次售后分析機(jī)會(huì)，能提供個(gè)性化作圖，能提供對(duì)應(yīng)的技術(shù)指導(dǎo)。

　　（6）可接受不定時(shí)分批送樣，為保證報(bào)告周期，從下單開始計(jì)算，10天內(nèi)完成收樣、檢測(cè)與個(gè)性化分析報(bào)告、原始數(shù)據(jù)的發(fā)放。（投標(biāo)人需提供書面承諾書）

　　（7）為保證檢測(cè)質(zhì)量和售后服務(wù)，檢測(cè)機(jī)構(gòu)具有針對(duì)病原宏基因組或致病菌高通量檢測(cè)項(xiàng)目檢測(cè)技術(shù)的能力，提供證明資料。

　　（8）投標(biāo)人承擔(dān)本項(xiàng)目所有樣本轉(zhuǎn)運(yùn)物流工作，提供可查詢的物流運(yùn)輸，確保樣本運(yùn)輸?shù)臅r(shí)效性、安全性，并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測(cè)對(duì)樣本質(zhì)量的要求。

　　（9）相關(guān)項(xiàng)目（細(xì)菌二代高通量檢測(cè)）與3家以上相關(guān)單位的科室有合作，每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測(cè)報(bào)告作為證明。

　　（10）服務(wù)供應(yīng)商配備專門的服務(wù)團(tuán)隊(duì)，對(duì)發(fā)放后的報(bào)告進(jìn)行解讀，并安排分析人員上門為期兩周的個(gè)性化分析結(jié)果及方法進(jìn)行培訓(xùn)，使用者若有需求，可以2小時(shí)內(nèi)到達(dá)，處理客戶相關(guān)的數(shù)據(jù)問題。

　　（四）項(xiàng)目實(shí)施要求

　　1、項(xiàng)目期間對(duì)采購方提供的樣本完成宏基因測(cè)序60份，細(xì)菌全基因測(cè)序60份，病原一代測(cè)序50份。上述三個(gè)項(xiàng)目檢測(cè)份數(shù)可根據(jù)采購方實(shí)際工作需要調(diào)整，價(jià)格按實(shí)際成交價(jià)折算，直至完成合同總價(jià)服務(wù)終止。

　　2、必須對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)信息保密，不得向除采購人外的任何單位與個(gè)人透露，否則取消其中標(biāo)資格；如造成經(jīng)濟(jì)損失及不良影響的，追究其經(jīng)濟(jì)賠償責(zé)任和法律責(zé)任。

　　3、服務(wù)供應(yīng)商配備專門的服務(wù)團(tuán)隊(duì)，對(duì)發(fā)放后的報(bào)告進(jìn)行解讀。

　　4、樣本管理：服務(wù)方保證對(duì)采購方委托標(biāo)本僅進(jìn)行委托項(xiàng)目檢測(cè)，不作其他任何用途（如贈(zèng)予他人或開展科學(xué)研究等），并保證在檢測(cè)完成后將委托標(biāo)本按生物安全有關(guān)要求全部銷毀。

　　5、結(jié)果報(bào)告：

　　（1）服務(wù)供應(yīng)商須滿足采購人對(duì)報(bào)告的特殊要求，將檢驗(yàn)報(bào)告及檢驗(yàn)結(jié)果匯總表及時(shí)發(fā)送到指定地點(diǎn)。

　　（2）服務(wù)供應(yīng)商有完善的檢驗(yàn)報(bào)告出現(xiàn)異常情況的處理流程。

　　（3）服務(wù)供應(yīng)商保證所出具的檢驗(yàn)報(bào)告具有法律效力。

　　6、監(jiān)督管理：

　　（1）服務(wù)供應(yīng)商應(yīng)建立相應(yīng)的管理制度、管理架構(gòu)，制定符合本項(xiàng)目要求的各項(xiàng)管理服務(wù)質(zhì)量指標(biāo)。

　　（2）服務(wù)供應(yīng)商必須保存好每批標(biāo)本檢測(cè)實(shí)驗(yàn)原始記錄，包括樣品編號(hào)、結(jié)果數(shù)據(jù)、檢測(cè)日期、檢測(cè)方法、質(zhì)量控制、試劑生產(chǎn)廠家/批號(hào)/有效期、環(huán)境溫度/濕度、操作者/復(fù)核者等，并接受采購人的各項(xiàng)監(jiān)督和檢查，包括不定期上門監(jiān)督管理，對(duì)采購人提出的合理意見必須及時(shí)做出有效響應(yīng)。

　　（五）經(jīng)費(fèi)說明

　　本項(xiàng)目設(shè)置最高總價(jià)為人民幣柒萬捌仟元整（78000元）。

　　五、申請(qǐng)材料報(bào)送截止時(shí)間和方式

　　（一）申請(qǐng)材料報(bào)送截止日期：2024年10月14日。

　　（二）報(bào)送方式：按照本公告第三條要求提交報(bào)名材料，一式五份寄送到江門市蓬江區(qū)星河路10號(hào)江門市疾控中心。公示期限為5個(gè)工作日，接受社會(huì)各界有意向的服務(wù)單位報(bào)名。時(shí)間截止后不再受理其他報(bào)名。

　　六、聯(lián)系方式

　　聯(lián)系人：梁先生，聯(lián)系電話：0750-3288580；

　　地址：江門市蓬江區(qū)星河路10號(hào)。

　　江門市衛(wèi)生健康局

　　2024年10月8日