1936年7月，中共中央成立了少數(shù)民族工作委員會，設(shè)立中共中央蒙古工作委員會。8月，中央關(guān)于內(nèi)蒙古工作的指示信提出，建立民族統(tǒng)一戰(zhàn)線，不但應當團結(jié)蒙古廣大平民群眾，并且應當把王公、軍人、喇嘛、知識分子也都團結(jié)在內(nèi)。根據(jù)蒙古民族的社會發(fā)展情況和王公、喇嘛等在群眾中的地位和信仰，應當歡迎他們中的進步分子成為目前民族運動的領(lǐng)導者，同時組織與吸引廣大群眾到斗爭中來，以壯大抗日力量。9月，成立中共中央定邊少數(shù)民族工作委員會，任李維漢為書記。

1937年7月，成立中共中央少數(shù)民族工作委員會，任高崗為書記，下設(shè)回民工作部和蒙古工作部。1938年11月，中共中央成立西北工作委員會(簡稱西北工委)，主持除陜甘寧邊區(qū)以外的西北地區(qū)地下黨的工作，尤其是少數(shù)民族工作，并把過去負責民族工作的機構(gòu)合并進來；還專門設(shè)立民族問題研究室，系統(tǒng)進行中國少數(shù)民族問題的研究工作。

1937年8月，中共中央在抗日救國十大綱領(lǐng)中提出動員蒙古族、回族及一切少數(shù)民族共同抗日的方針。在黨的六屆六中全會上，毛澤東在《論新階段》報告中提出：允許蒙、回、藏、苗、彝、畬各民族與漢族有平等的權(quán)利，在共同對日的原則之下，有自己管理自己事務(wù)之權(quán)，同時與漢族聯(lián)合建立統(tǒng)一的國家。

1940年4月和7月，中共中央先后原則上批準西北工委起草的《關(guān)于回回民族問題的提綱》和《關(guān)于抗戰(zhàn)中蒙古民族問題提綱》。文件規(guī)定了實行民族平等，尊重民族文化、風俗習慣和宗教信仰，幫助改善與提高各少數(shù)民族人民生活水平，改善各民族關(guān)系等具體政策。這是黨在抗戰(zhàn)期間開展民族工作的重要指導性文件。1941年5月公布的《陜甘寧邊區(qū)施政綱領(lǐng)》，具體提出了“建立蒙回民族的自治區(qū)”，這是中國共產(chǎn)黨解決民族問題的一個創(chuàng)造。民族區(qū)域自治后來成為黨處理少數(shù)民族問題的一項基本政策。

1937年在中央黨校舉辦少數(shù)民族班，1939年至1940年在陜北公學成立蒙古青年隊、少數(shù)民族工作隊和民族部等。1941年9月中共中央在延安創(chuàng)辦的民族學院，是黨培養(yǎng)少數(shù)民族干部和研究少數(shù)民族問題的專門機構(gòu)。第一次招收蒙、回、藏、苗、彝、滿、漢等各族青年300多名。學員畢業(yè)后，紛紛奔赴民族地區(qū)或抗日戰(zhàn)場，進一步加強了民族間的合作和團結(jié)，鞏固了抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線。

在大革命時期，黨在多個會議決議案中提出對宗教問題要持慎重態(tài)度，告誡黨員不要故意制造與宗教信徒發(fā)生實際沖突的機會。土地革命時期，黨提出了保證工農(nóng)信教自由的主張。1935年紅軍長征到達陜北后，不僅明確了宗教信仰自由的原則，而且還提出了對信教群眾、神職人員及宗教場所實行保護的政策，在根據(jù)地產(chǎn)生了積極的政治影響。抗日戰(zhàn)爭時期，黨不斷完善宗教政策。

1938年1月，《晉察冀邊區(qū)軍政民代表大會決議案》指出，邊區(qū)政府應扶植民眾團體之組織，予人民以集會、結(jié)社、言論和出版、信仰等自由；在選舉條例中，規(guī)定凡在邊區(qū)境內(nèi)之人民，不分性別、職業(yè)、民族、階級、黨派、信仰、文化程度、居住年限，年滿18歲者，經(jīng)選舉委員會登記后，均有選舉權(quán)及被選舉權(quán)。《陜甘寧邊區(qū)施政綱領(lǐng)》規(guī)定：保證一切抗日人民（地主、資本家、農(nóng)民、工人等）的信仰自由權(quán)，尊重蒙、回民族的宗教信仰與風俗習慣。1942年2月15日《新華日報》發(fā)表的《共產(chǎn)黨對宗教的態(tài)度》社論，較為完整、系統(tǒng)地闡述了黨的宗教信仰自由政策，即絕不去強迫別人遵從自己的信仰。各人有各人的宗教信仰自由，每個人有舉行自己所信奉的這一種或那一種宗教儀式的自由。同時，每個人也有不屬于任何宗教團體而保持自己不信宗教的自由。

在這些政策的影響下，很多宗教界人士積極建言獻策，許多人參加了“三三制”政權(quán)，成為根據(jù)地的建設(shè)者和保衛(wèi)者。

1940年1月，毛澤東在《新民主主義論》中明確指出：共產(chǎn)黨員可以和某些唯心論者甚至宗教徒，建立在政治行動上的反帝反封建的統(tǒng)一戰(zhàn)線。

抗日戰(zhàn)爭時期延安的教堂

聶榮臻積極支持五臺山僧人要求，團結(jié)僧侶參加邊區(qū)建設(shè)和抗日工作。一些宗教界領(lǐng)袖走上了與共產(chǎn)黨長期合作的道路。1941年5月，《陜甘寧邊區(qū)施政綱領(lǐng)》明確規(guī)定：允許任何外國人到邊區(qū)游歷、參加抗日工作，或在邊區(qū)進行實業(yè)文化與宗教的活動。1942年1月，中共中央明確提出對傳教士要進行團結(jié)和保護。1944年來延安考察的美國著名記者斯坦因?qū)⒃L問陜甘寧邊區(qū)的經(jīng)歷寫進自己的書中，他說：親眼所見延安有500個基督教徒，沒有一個因宗教信仰蒙受不利。這些對抗日根據(jù)地宗教狀況的真實報道，打破了國民黨當局對根據(jù)地的封鎖，使當時盛傳“共產(chǎn)黨消滅宗教”的謠言不攻自破。